1、司法鑒定是民事訴訟法規(guī)定的七種證據(jù)之一，沒有“法庭證據(jù)”這個概念。依據(jù)是民訴法第63條。
2、《協(xié)議書》被篡改，即違背甲方的意思表示，相關(guān)部分或全部（視詳細(xì)情況）屬于可撤銷、可變更合同的情況，而不是無效。關(guān)于合同無效的情況，民法通則和合同法有明確的規(guī)定，主要是那些損害國家和公共利益的情況。依據(jù)是合同法第54條。
3、如果你說的“內(nèi)容和格式有明顯不符合甲方利益的約束補(bǔ)充條款”是篡改的，可以要求撤銷或變更。依據(jù)是合同法第54條。
4、“某單位的印章是后蓋上去的，之前沒有印章，該合同”可以請求撤銷。
備注：合同條款確實不公平，可以根據(jù)合同法第54-56條的相關(guān)規(guī)定去主張合同條款的變更或撤銷：
第54條 下列合同，當(dāng)事人一方有權(quán)請求人民法院或者仲裁機(jī)構(gòu)變更或者撤銷：
1、因重大誤解訂立的；
2、在訂立合同時顯失公平的。
一方以欺詐、脅迫的手段或者乘人之危，使對方在違背真實意思的情況下訂立的合同，受損害方有權(quán)請求人民法院或者仲裁機(jī)構(gòu)變更或者撤銷。 當(dāng)事人請求變更的，人民法院或者仲裁機(jī)構(gòu)不得撤銷。
第55條 有下列情形之一的，撤銷權(quán)消滅：
具有撤銷權(quán)的當(dāng)事人自知道或者應(yīng)當(dāng)知道撤銷事由之日起一年內(nèi)沒有行使撤銷權(quán)； 具有撤銷權(quán)的當(dāng)事人知道撤銷事由后明確表示或者以自己的行為放棄撤銷權(quán)。
第56條 無效的合同或者被撤銷的合同自始沒有法律約束力。合同部分無效，不影響其他部分效力的，其他部分仍然有效。
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